Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pola1P33609 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pola1P33609 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms