Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HexaP29416 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HexaP29416 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HexaP29416 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HexaP29416 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms