Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms