Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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