Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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