Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BgnP28653 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BgnP28653 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BgnP28653 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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