Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms