Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms