Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af2P26369 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms