Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmo2P25801 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms