Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms