Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd11P23813 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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