Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hoxd12P23812 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hoxd12P23812 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hoxd12P23812 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hoxd12P23812 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hoxd12P23812 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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