Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZfaP23607 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms