Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tsta3P23591 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms