Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms