Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms