Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BdnfP21237 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms