Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fcer1aP20489 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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