Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NelfeP19426 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NelfeP19426 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NelfeP19426 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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