Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RargP18911 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RargP18911 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RargP18911 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RargP18911 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms