Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms