Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms