Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms