Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GhrP16882 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GhrP16882 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GhrP16882 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GhrP16882 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GhrP16882 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GhrP16882 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms