Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gabra6P16305 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms