Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp53P15975 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp53P15975 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms