Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms