Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb1P12658 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms