Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt8P11679 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms