Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DmdP11531 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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DmdP11531 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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DmdP11531 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DmdP11531 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms