Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl2P10148 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms