Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms