Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprqP0C5E4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprqP0C5E4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprqP0C5E4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprqP0C5E4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprqP0C5E4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprqP0C5E4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprqP0C5E4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprqP0C5E4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprqP0C5E4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprqP0C5E4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprqP0C5E4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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