Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifna9P09235 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms