Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb7P09024 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms