Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefmP08553 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefmP08553 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefmP08553 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms