Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtrP07309 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms