Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csf1P07141 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms