Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P04212 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P04212 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
P04212 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P04212 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P04212 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P04212 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P04212 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P04212 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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