Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01851 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01851 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01851 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01851 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01851 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01851 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01851 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01851 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01851 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01851 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01851 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms