Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01678 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01678 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01678 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01678 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms