Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl2O89104 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms