Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopeO89079 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CopeO89079 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CopeO89079 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CopeO89079 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms