Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClppO88696 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClppO88696 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClppO88696 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms