Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms