Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms