Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtssO70370 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtssO70370 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtssO70370 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtssO70370 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtssO70370 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms