Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tlx3O55144 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms