Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr1O55100 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms